Épisode 1
Mission suicide
Les conditions de vie sont difficiles pour les humains maintenant qu’ils sont sous l’occupation des cylons. Adama se sent responsable pendant qu’un attentat se prépare contre une cérémonie de la Police de la Nouvelle Caprica (PNC).
Épisode 2
La Grande rafle
Après une série d’attentats suicides, les cylons ordonnent à la PNC de capturer 200 personnes soupçonnées d’être dans la résistance. Les prisonniers devraient être exécutés pour envoyer un message.
Épisode 3
Exodus – partie 1
Le mouvement de résistance organise une mission pour sauver les dissidents de l'exécution programmée, alors que le Galactica se prépare à sauver les humains sur la Nouvelle Caprica. Une copie de Numéro Trois doute de sa foi et visite un oracle humain qui lui dit que Héra, l'enfant hybride, est vivante.
Épisode 4
Exodus – partie 2
Le Galactica et les résistants organisent une attaque pour se libérer du contrôle des Cylons. Mais au moment où l’attaque tourne à l’avantage des humains, les cylons prennent une décision radicale.
Épisode 5
Le Cercle
Le Cercle est un tribunal secret sur le Galactica. Jammer et les autres coloniaux y sont jugés pour avoir aidés les Cylons pendant l’occupation de la Nouvelle Caprica.
Épisode 6
La Tête de Lion
Alors que Starbuck et Tigh sèment le désordre au sein de l'équipage du Galactica, Baltar tente d'aider les cylons à gérer un virus se propageant chez eux.
Épisode 7
La Balise
Adama et Roslin sont en désaccord sur la moralité à déployer une arme biologique visant à détruire les cylons. Numéro Trois torture Baltar pour découvrir qui a créé le virus.
Épisode 8
Héros
Adama doit faire face à son passé lorsque le Lieutenant Daniel «Bulldog» Novacek, un pilote que l'on croyait mort lors d'une mission secrète sous le commandement de l'amiral, s'échappe des cylons et arrive sur le Galactica.
Épisode 9
Le Grand combat
Pour détendre l’atmosphère à bord du Galactica, Adama organise des matchs de boxe.
Des flashbacks montrent les raisons de la dispute entre Starbuck et Apollo sur la Nouvelle Caprica.
Épisode 10
Le Passage
Le Galactica manque de nourriture depuis que les systèmes d’alimentation ont été contaminés.
Starbuck doit mener le vaisseau à bord d’une intense zone de radiation
Épisode 11
L’Oeil de Jupiter
La flotte est en orbite autour de la planète aux algues pour se ravitailler, et découvre le temple des Cinq. Ce temple contiendrait l'artefact de l'œil de Jupiter, une relique pouvant montrer le chemin vers la Terre. Mais les Cylons sont eux aussi intéressés par l’objet.
Épisode 12
Extase
D’Anna organise un plan pour récupérer l’œil de Jupiter.
Épisode 13
L’interrogatoire
Baltar est accusé de trahison.
Apollo se rend dans un bar appelé «Chez Joe» où ses problèmes relationnels avec Dee, Starbuck et Sam se révèlent.
Épisode 14
Les Sagitarrons
Helo doit mener une enquête sur un docteur, qui soigne les réfugiés civils. Il est soupçonné de tuer ses patients de Sagittaron.
Épisode 15
Un jour particulier
Cally et le chef Tyrol sont en danger, prisonniers d’un sas avec une dangereuse brèche dans la coque.
A l’occasion de son anniversaire de mariage, Adama voit des souvenirs de sa femme décédée refaire surface.
Épisode 16
Grève générale
Roslin échappe de peu à un accident mortel. Pendant ce temps, le chef Tyrol devient l’organisateur d’une grève sur le Galactica pour obtenir de meilleures conditions de travail pour la flotte.
Épisode 17
Ouragan
Starbuck rentre de mission en Viper et dit avoir heurter un vaisseau Cylon. Mais aucune trace du choc n’est visible. Adama émet des doutes à propos de son sens du devoir et de sa santé mentale.
Épisode 18
Affrontement
Le jugement de Baltar arrive à grands pas. Mais ses avocats échappent de justesse à un attentat.
Épisode 19
Croisement – partie1
Le procès de Baltar soulève de nouvelles questions et réveille le souvenir douloureux de sa femme au colonel Tight.
Épisode 20
Croisement – partie2
Baltar est acquitté des accusations de trahison. Le Galactica se rend dans une nébuleuse pour y chercher un nouvel indice pour trouver la Terre.
