En 2006, il joue dans la sitcom So notorious avec Tory Spelling puis est choisi pour interpréter le tout-puissant Gabriel Gray, alias Sylar, le méchant de la série Heroes qui découpe les cerveaux des gens dotés de super-pouvoirs pour en étudier le fonctionnement et absorber leur don.

Ce rôle lui apporte la célébrité. Quinto campe un Sylar terrifiant, ambigu, solitaire et calculateur, opposé à tous les protagonistes de l'histoire. Notamment son double positif, Peter Petrelli, interprété par Milo Ventimiglia, capable lui aussi d'absorber les pouvoirs des autres mais sans avoir besoin de les tuer pour autant.